秦朝时巴郡是今四川境内旧保宁、顺庆、夔州、重庆四府、及沪州；东汉末年三国时期巴郡为今四川阆中；西晋时为今重庆市内部分地区。

秦朝时设立郡置，今四川境内旧保宁、顺庆、夔州、重庆四府、及沪州皆其地，治江州（今重庆市江北区）。汉朝时，巴郡范围有所扩张，并且从西汉的１１县增加到了东汉的１４县。

东汉末年三国时期，巴郡建制连续发生变化，治安汉，故治在今四川南充县北，寻改为巴西郡，移治阆中。后从中分出巴西郡、巴东郡、宕渠郡等，范围大大缩小。到西晋时，郡辖只剩下４县，基本都在今天重庆市范围，仍然以江州为郡治。南齐徙今巴县治。隋朝巴郡辖３县，治所江州改名为巴县。唐朝以后废除郡置，改为渝州，巴郡的名称不再使用。